Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5DP30049 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5DP30049 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms