Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms