Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms