Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms