Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC3P02656 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC3P02656 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC3P02656 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC3P02656 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC3P02656 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC3P02656 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC3P02656 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC3P02656 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC3P02656 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC3P02656 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC3P02656 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms