Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX3O75364 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX3O75364 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms