Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms