Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms