Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms