Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC23IPQ9Y6Y8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC23IPQ9Y6Y8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms