Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MAD1L1Q9Y6D9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAD1L1Q9Y6D9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms