Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF2Q9Y5W3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF2Q9Y5W3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF2Q9Y5W3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF2Q9Y5W3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms