Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB1Q9Y5F3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB1Q9Y5F3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHB1Q9Y5F3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB1Q9Y5F3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB1Q9Y5F3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB1Q9Y5F3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB1Q9Y5F3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms