Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD3Q9Y3V2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RWDD3Q9Y3V2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RWDD3Q9Y3V2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RWDD3Q9Y3V2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RWDD3Q9Y3V2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms