Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC1Q9Y3B2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC1Q9Y3B2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC1Q9Y3B2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC1Q9Y3B2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms