Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF1Q9Y375 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF1Q9Y375 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFAF1Q9Y375 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF1Q9Y375 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF1Q9Y375 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms