Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL20Q9Y2M5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL20Q9Y2M5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL20Q9Y2M5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms