Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MED23Q9ULK4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
MED23Q9ULK4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MED23Q9ULK4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MED23Q9ULK4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
MED23Q9ULK4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MED23Q9ULK4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms