Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIMS3Q9UJD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIMS3Q9UJD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS3Q9UJD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMS3Q9UJD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms