Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGEF1Q9UJ41 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGEF1Q9UJ41 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGEF1Q9UJ41 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
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