Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEFF2Q9UIK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEFF2Q9UIK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEFF2Q9UIK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEFF2Q9UIK5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms