Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX20Q9UHI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX20Q9UHI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX20Q9UHI6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DDX20Q9UHI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms