Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCSK1NQ9UHG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCSK1NQ9UHG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCSK1NQ9UHG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms