Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3BQ9UH17 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3BQ9UH17 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3BQ9UH17 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms