Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS7AQ9UBW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS7AQ9UBW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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