Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HDAC6Q9UBN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC6Q9UBN7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC6Q9UBN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
HDAC6Q9UBN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms