Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD9

CLCF1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCF1Q9UBD9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCF1Q9UBD9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCF1Q9UBD9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCF1Q9UBD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms