Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN10Q9UBB4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN10Q9UBB4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN10Q9UBB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms