Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGFRNQ9P2B2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGFRNQ9P2B2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGFRNQ9P2B2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms