Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC54.12■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC54.11■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC54.1■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
CCDC180Q9P1Z9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC54.06■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC54.03■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC54.02■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC54.01■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.01■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC54.01■■■■■ 6.24
CCDC180Q9P1Z9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.99■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC53.98■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC53.98■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.97■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC53.95■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
CCDC180Q9P1Z9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC53.93■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC53.91■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC53.91■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.9■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC53.89■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC53.88■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
CCDC180Q9P1Z9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC53.87■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC53.86■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC53.84■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC53.83■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC53.82■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
CCDC180Q9P1Z9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.8■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC53.79■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC53.79■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.77■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.77■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC53.76■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC53.75■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC53.71■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC53.71■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC53.7■■■■■ 6.19
CCDC180Q9P1Z9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC53.69■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC53.69■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC53.68■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC53.68■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC53.66■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC53.66■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC53.64■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC53.63■■■■■ 6.18
CCDC180Q9P1Z9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC53.61■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC53.6■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC53.59■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.58■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC53.57■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.56■■■■■ 6.17
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC53.53■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms