Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKS1Q9NXB0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKS1Q9NXB0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKS1Q9NXB0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKS1Q9NXB0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKS1Q9NXB0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKS1Q9NXB0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms