Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf109Q9NX04 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf109Q9NX04 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf109Q9NX04 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms