Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS2

MRPS18A, 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18AQ9NVS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS18AQ9NVS2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS18AQ9NVS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18AQ9NVS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS18AQ9NVS2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms