Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC87Q9NVE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC87Q9NVE4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC87Q9NVE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC87Q9NVE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC87Q9NVE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC87Q9NVE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC87Q9NVE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC87Q9NVE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCDC87Q9NVE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC87Q9NVE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 606.9 ms