Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00846Q9NV44 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00846Q9NV44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms