Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPORSQ9NS56 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPORSQ9NS56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPORSQ9NS56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPORSQ9NS56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms