Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF4Q9NR80 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF4Q9NR80 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF4Q9NR80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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