Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GDF3Q9NR23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF3Q9NR23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF3Q9NR23 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF3Q9NR23 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms