Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS2Q9NR19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSS2Q9NR19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms