Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM10Q9NQV6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM10Q9NQV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRDM10Q9NQV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRDM10Q9NQV6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDM10Q9NQV6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms