Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FSCN3Q9NQT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSCN3Q9NQT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN3Q9NQT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN3Q9NQT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN3Q9NQT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms