Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS4Q9NQG7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HPS4Q9NQG7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS4Q9NQG7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPS4Q9NQG7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS4Q9NQG7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms