Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNK9Q9NPC2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK9Q9NPC2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK9Q9NPC2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms