Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC24A3Q9HC58 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A3Q9HC58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms