Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM165Q9HC07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM165Q9HC07 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM165Q9HC07 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM165Q9HC07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms