Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBM6

TAF9B, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9BQ9HBM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9BQ9HBM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF9BQ9HBM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF9BQ9HBM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF9BQ9HBM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms