Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLK4Q9HAZ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK4Q9HAZ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK4Q9HAZ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK4Q9HAZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms