Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAF1Q9H7N4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAF1Q9H7N4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAF1Q9H7N4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SCAF1Q9H7N4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SCAF1Q9H7N4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SCAF1Q9H7N4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms