Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C8orf33Q9H7E9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C8orf33Q9H7E9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C8orf33Q9H7E9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C8orf33Q9H7E9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C8orf33Q9H7E9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C8orf33Q9H7E9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8orf33Q9H7E9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms