Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR55Q9H6Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR55Q9H6Y2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR55Q9H6Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms